Aku soojusjuhtiminehõlmab peamiselt jahutamist, kütmist ja temperatuuri ühtlustamist. Jahutus- ja küttefunktsioonid kohanduvad peamiselt väliskeskkonna temperatuuri võimaliku mõjuga akule. Temperatuuri ühtlustamine vähendab temperatuuride erinevusi akupaki sees, vältides aku kiiret halvenemist, mis on põhjustatud teatud piirkondade ülekuumenemisest.
Üldiselt jagunevad aku jahutusmeetodid peamiselt kolme kategooriasse: õhkjahutus, vedelikjahutus ja otsejahutus. Õhkjahutus kasutab loomulikku õhku või jahutusõhku sõitjateruumist, et saavutada soojusvahetus ja jahutus üle aku pinna. Vedeljahutus kasutab tavaliselt aku soojendamiseks või jahutamiseks sõltumatut jahutusvedeliku torustikku; see on praegu peamine jahutusmeetod, mida kasutatakse Tesla ja Volti akudes. Otsejahutussüsteemid välistavad vajaduse aku jaoks eraldi jahutustorustiku järele, kasutades selle jahutamiseks otse külmutusagensit.
1. Õhkjahutussüsteem
Varajased akud kasutasid oma väiksema mahu ja energiatiheduse tõttu sageli õhkjahutust. Õhkjahutus jaguneb kahte põhikategooriasse: loomulik õhkjahutus ja sundõhkjahutus (ventilaatori abil), kasutades aku jahutamiseks sõitjateruumi loomulikku või jahedat õhku.
Praegu asuvad 48 V kergete hübriidsõidukite 48 V akud üldjuhul sõitjateruumis ja neid jahutatakse õhuga. Õhkjahutussüsteemid on ehituselt suhteliselt lihtsad, tehnoloogiliselt küpsed ja madala hinnaga. Kuid õhu piiratud soojuseraldusvõime tõttu on nende soojusvahetuse efektiivsus madal, mille tulemuseks on halb sisetemperatuuri ühtlus ja raskused aku temperatuuri täpsel reguleerimisel. Seetõttu sobivad õhkjahutussüsteemid üldiselt lühikeste vahemaade ja kergete sõidukite jaoks.
2. Vedelikjahutussüsteemid
Vedeljahutus hõlmab jahutusvedeliku kasutamist akuga soojuse vahetamiseks. Jahutusvedelikud jagunevad kahte tüüpi: need, mis võivad vahetult kokku puutuda akuelementidega (silikoonõli, kastoorõli jne) ja need, mis puutuvad elementidega kokku veekanalite kaudu (vesi ja etüleenglükool jne); praegu kasutatakse sagedamini vee ja etüleenglükooli segu. Vedeljahutussüsteemid sisaldavad tavaliselt jahutit, mis on ühendatud jahutustsükliga, kasutades külmutusagensit akust soojuse eemaldamiseks. Põhikomponendid on kompressor, jahuti ja veepump. Kompressor kui külmutusseadme toiteallikas määrab kogu süsteemi soojusvahetusvõime. Jahuti hõlbustab soojusvahetust külmutusagensi ja jahutusvedeliku vahel ning soojusvahetuse hulk määrab otseselt jahutusvedeliku temperatuuri. Veepump määrab jahutusvedeliku voolukiiruse torudes; kiirem voolukiirus tagab parema soojusvahetuse jõudluse ja vastupidi.
Vedeljahutussüsteemid pakuvad suuremat paindlikkust. Akumoodulite vahele saab paigaldada jahutuskanalid (praegu tavapärane lähenemine), aku põhjas saab kasutada jahutusplaate või kasta elemendid või moodulid jahutusvedelikku. Vedelikjahutussüsteemide eeliste hulka kuuluvad kõrged soojusülekandetegurid, kiired voolukiirused, hea temperatuuri ühtlus ja täpne temperatuuri reguleerimine. Puuduste hulka kuuluvad süsteemi keerukus, kõrged tihendusnõuded, jahutussüsteem, mis moodustab olulise osa aku massist, ja suhteliselt kõrge hind.